Fundamental Researchrae.ru
Scientific journal

Fundamental Research

ISSN 1812-7339VAK ListRSCI IF = 1,798

COMPARATIVE ANALYSIS OF THE FREQUENCY DISTRIBUTION OF ALLELES AND GENOTYPES POLYMORPHISMS RS 231775 AND RS 3087243 GENE CTLA-4 IN PATIENTS WITH DIABETES MELLITUS TYPE 1 AND TYPE 1 DIABETES COMBINED WITH AUTOIMMUNE THYROIDITIS

Repina E.A.1,Boldyreva M.N.2,Suntsov Yu.I.1,Bateneva E.I.3,Kadochnikova V.V.3,Ilin A.V.1,Troshina E.A.1
1FGBU «Endocrinology Research Centre» The Ministry of Health
2FGBU «Institute of Immunology» FMBA of Russia
3ZAO «DNA Technology»

Сахарный диабет 1 типа (СД1) – полигенное многофакторное заболевание, развитие которого связано с аутоиммунной деструкцией β-клеток поджелудочной железы.

Генетическая предрасположенность играет определяющую роль в механизмах манифестации и прогрессирования аутоиммунного воспаления при СД1 [2, 4].

К настоящему времени выявлено 18 локусов, находящихся на разных хромосомах, которые в той или иной степени предрасполагают к СД1. Некоторые из них ассоциированы не только с СД1, но и с другими аутоиммунными заболеваниями (АИЗ), такими как АИЗ щитовидной железы, болезнь Аддисона, целиакия, системная красная волчанка, ревматоидный артрит [8].

На одном из таких локусов находится ген CTLA-4, который занимает около 6,2 kb на второй хромосоме (2q33), состоит из 4 экзонов. Его белковый продукт экспрессируется Т-лимфоцитами на поздних стадиях активации и ингибирует их пролиферацию.

В многочисленных работах, посвященных патогенетической роли гена CTLA-4, была обнаружена ассоциация ряда однонуклеотидных полиморфизмов данного гена с развитием СД1 [6], диффузного токсического зоба (ДТЗ) [9] и аутоиммунного тиреоидита (АИТ) [10].

Из всех вариантов сочетаний АИЗ наиболее частой является ассоциация СД1 с АИТ. Распространенность АИТ у родственников больных СД1 достигает 48 % по сравнению с общей популяцией – лишь 3–10 % [11]. До 50 % больных СД1 имеют положительные антитела к ткани щитовидной железы (АтЩЖ), из них примерно у 50 % отмечались клинические проявления АИТ [9]. С другой стороны, 2,3 % детей с АИТ имели антитела к островковым клеткам поджелудочной железы (ICA) по сравнению с 0 % в контроле [7].

Трудности в изучении особенностей иммуногенетики СД1 всегда были сопряжены с клинической гетерогенностью данного заболевания. Многочисленные исследования показали сильное влияние наряду с генами HLA II класса, гена CTLA-4 на совместную предрасположенность к СД1 и АИТ в семьях и у одного и того же человека [5].

Наиболее часто в литературе упоминаются два полиморфизма гена CTLA-4 – rs 231775 (49 A/G) и rs 3087243 (CT60 A/G). Первый из них – более исследованный полиморфизм, расположенный в первом экзоне гена CTLA-4, характеризуется заменой треонина на аланин в 17 кодоне лидерного пептида и ассоциирован со многими заболеваниями [1, 3].

Полиморфный маркер rs3087243, расположенный в промоторной области гена CTLA-4, был исследован ранее в основном в связи с риском развития аутоиммунных заболеваний, кодирует антиген 4 цитотоксических Т-лимфоцитов и отвечает за уровень активации Т-клеток [3].

Задачей настоящего исследования является сравнительный анализ распределения частот аллелей и генотипов двух полиморфизмов rs 231775 и rs 3087243 гена CTLA-4 у пациентов с СД1 и пациентов, имеющих сочетание СД1 с АИТ.

Материалы и методы исследования

В исследование было включено 174 пациента с СД1, которые находились на обследовании и лечении в ФГБУ «Эндокринологический научный центр» МЗ РФ. Все пациенты были разделены на 2 группы: в первую группу вошел 91 пациент с СД1 и аутоиммунным тиреоидитом (АИТ), вторую группу составили 83 пациента с СД1 и отрицательными титрами АтЩЖ. При исследовании полиморфизма rs 231775 гена CTLA-4 были сформированы следующие группы:

1) СД1 + серонегативные по АтЩЖ (n = 70), средний возраст пациентов 27,89 ± 12,16 лет, из них мужчин – 40 (57 %), женщин – 30 (43 %);

2) СД1 + АИТ (n = 60), средний возраст пациентов 36,05 ± 12,39 лет, из них мужчин – 10 (17 %), женщин – 50 (83 %).

При исследовании полиморфизма rs 3087243 гена CTLA-4 – группы:

1) СД1 + серонегативные по АтЩЖ (n = 65), средний возраст пациентов 27,34 ± 12,24 лет, из них мужчин – 37 (65 %), женщин – 28 (35 %);

2) СД1 + АИТ (n = 28), средний возраст пациентов 36,68 ± 13,24 лет, из них мужчин – 2 (7 %), женщин – 26 (93 %).

Контрольную группу составили 108 человек из московской популяции без аутоиммунных заболеваний и отягощенной наследственности по ним, средний возраст в контрольной группе (n = 108) – 46,3 ± 9,3 лет, мужчин 73 (68 %), женщин – 35 (32 %). У всех пациентов предварительно было получено информированное согласие на проведение данного исследования.

Типирование однонуклеотидных полиморфизмов rs 231775 и rs 3087243 гена CTLA-4 проводили методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с флюоресцентными метками и автоматической регистрацией результатов реакции в режиме реального времени (real-time PCR) наборами компании «ДНК-Технология» (Москва) на приборе ДТ-96 («ДНК-Технология») в соответствии с инструкциями производителя.

Количественное определение титров аутоантител к тиреоглобулину (ATG) и тиреопероксидазе (ATPO) в сыворотках крови осуществляли методом непрямого иммуноферментного анализа с использованием наборов фирмы «Biomerica» (лаборатория клинической биохимии ФГБУ «Эндокринологический научный центр» МЗ РФ, зав. – А.В. Ильин).

Статистическую обработку данных проводили с использованием стандартных подходов, используемых при проведении популяционно-генетических исследований.

Аллельные варианты полиморфных генов подвергались классическому молекулярно-эпидемиологическому анализу – сопоставлению встречаемости аллелей и генотипов у больных СД1, СД1 + АИТ и контролей. Тест на соответствие контрольной выборки равновесию Харди – Вайнберга проводили с использованием метода χ2 (α = 0,05, df = 1). Для выявления ассоциации между заболеванием и генотипом использовались мультипликативная и аддитивная модели наследования.

Ассоциацию между заболеванием и генотипом определяли с помощью критерия χ2 (c коррекцией Йейтса на непрерывность выборки), либо точным двусторонним критерием Фишера, сравнивая распределение генотипов и аллелей по каждому полиморфизму между группами пациентов и контролей. Статистика: аллель предрасположенности (риска) А против второго аллеля (протекторного) В. Анализ тенденций (trend test) проводили с использованием аддитивной модели наследования (тест Кохрана – Армитажа для линейных трендов с одной степенью свободы). Достоверными считали различия при уровне ошибки р ≤ 0,05/3 = 0,016, то есть допускали 1,6 % вероятность того, что найденная в выборке связь между переменными является лишь случайной особенностью данной выборки. Уменьшение уровня значимости связано с наличием множественных сравнений и, как следствие, введением поправки Бонферрони.

Показатели «отношения шансов» (OR-odds ratio) с 95 % доверительным интервалом (95 % CI) рассчитывались для «редкого» аллеля, носителей «редкого» аллеля (гетерозигот + гомозигот по «редкому» аллелю) относительно «частых» аллелей и гомозигот по «частому» аллелю соответственно. Аналогичный расчет проводился для гомозигот по «редкому» аллелю относительно гетерозигот и гомозигот по «частому» аллелю.

Сравнение частот встречаемости сочетаний генотипов проводилось с использованием критерия Краскела – Уоллиса и точного двустороннего критерия Фишера.

Отношение рисков (RR-related risk) рассчитано как отношение риска наступления события (СД1) у лиц, имеющих фактор риска (определенное сочетание генотипов) по отношению к контрольной группе.

Результаты исследования и их обсуждение

Нами впервые проведено сравнительное исследование SNP rs 231775 и rs 3087243 гена CTLA-4 у пациентов с СД1 и СД1 в сочетании с АИТ.

Исследование частоты встречаемости однонуклеотидной замены 49 A/G (rs231775), расположенной в первом экзоне гена CTLA4

Результаты исследования частот полиморфных вариантов гена CTLA4 в выборке пациентов с СД1, серонегативных по АтЩЖ, и случайной (контрольной) выборке представлены в табл. 1. Наблюдаемое распределение частот генотипов по исследованному локусу гена CTLA-4 в контрольной выборке соответствует теоретически ожидаемому равновесному распределению Харди – Вайнберга (p = 0,78).

Анализ распределения аллелей и генотипов полиморфизма rs 231775 гена CTLA-4 выявил повышение встречаемости «редкого» аллеля G среди больных СД1, серонегативных по АтЩЖ, – 81/140 (58 %), в сравнении со здоровыми лицами 91/216 (42 %) (OR = 1,89, 95 % CI: 1,23–2,90, р = 0,005) (табл. 1).

Таблица 1

Распределение аллелей и генотипов полиморфизма rs 231775 гена CTLA-4 у пациентов с СД1 и в контрольной группе

Группы

Частота генотипов, абс./отн.

Частота аллелей, абс./отн.

AA

AG

GG

Всего

A

G

Всего

СД1 без АтЩЖ

13/0,19

33/0,48

24/0,34

70/1

59/0,421

81/0,579

140/1

Контроль

35/0,32

55/0,51

18/0,17

108/1

125/0,579

91/0,421

216/1

Частота носителей «редкого» аллеля G у больных СД1, серонегативных по АтЩЖ (лица с генотипами АG и GG), была незначимо выше – 57/70 (81 %), чем в группе контроля – 73/108 (68 %) (относительно лиц с генотипом АА – OR = 2,1, 95 % CI: 1,02–4,34, p = 0,063). При этом частота генотипа GG достоверно выше в группе пациентов (34 %) по сравнению с группой контроля (17 %), p = 0,0116, OR = 2,1, 95 % CI: 1,21–3,5. Оценочный тест для анализа изменения степени ассоциации между генотипом CTLA-4 rs 231775 и предрасположенностью к развитию СД1, серонегативного по АтЩЖ, в зависимости от числа полиморфных аллелей (тренд-тест Кохрана – Армитажа) показал статистически значимые различия между сравниваемыми генотипами (p = 0,004), что свидетельствует о наличии тенденции к повышению степени ассоциации генотипа с риском развития изолированной формы СД1 при увеличении в генотипе количества аллелей G. Вывод о том, что носители аллеля G и генотипа GG имеют повышенный риск развития СД1, согласуется с данными ряда исследователей [1, 3].

Результаты исследования частот полиморфных вариантов гена CTLA4 в выборке пациентов с СД1, сочетанным с аутоиммунным тиреоидитом, и случайной (контрольной) выборке представлены в табл. 2.

Таблица 2

Распределение аллелей и генотипов полиморфизма rs 231775 гена CTLA-4 у пациентов с СД1, сочетанным с АИТ, и в контрольной группе

Группы

Частота генотипов, абс./отн.

Частота аллелей, абс./отн.

AA

AG

GG

Всего

A

G

Всего

СД1 + АИТ

27/0,45

21/0,35

12/0,2

60/1

75/0,625

45/0,375

120/1

Контроль

35/0,32

55/0,51

18/0,17

108/1

125/0,579

91/0,421

216/1

Анализ распределения аллелей и генотипов полиморфизма rs 231775 гена CTLA-4 среди больных СД1 с АИТ и доноров не выявил статистически значимых различий (p = 0,48 для «редких» аллелей, p = 0,15 для носителей «редкого» аллеля и p = 0,68 для генотипов, гомозиготных по «редкому» аллелю).

Результаты исследования частот полиморфных вариантов гена CTLA4 в выборке пациентов с изолированным СД1 и СД1, сочетанным с АИТ, представлены в табл. 3.

Анализ распределения аллелей и генотипов полиморфизма rs 231775 гена CTLA-4 выявил повышение встречаемости «редкого» аллеля G среди больных СД1, серонегативных по АтЩЖ, – 81/140 (58 %), в сравнении с пациентами, страдающими СД1 в сочетании с АИТ, – 45/120 (37,5 %) (OR = 2,29, 95 % CI: 1,39–3,77, р = 0,0016) (табл. 3).

Таблица 3

Распределение аллелей и генотипов полиморфизма rs 231775 гена CTLA-4 у пациентов с СД1 и СД1 в сочетании с АИТ

Группы

Частота генотипов, абс./отн.

Частота аллелей, абс./отн.

AA

AG

GG

Всего

A

G

Всего

СД1 без АтЩЖ

13/0,19

33/0,48

24/0,34

70/1

59/0,421

81/0,579

140/1

СД1 в сочетании с АИТ

27/0,45

21/0,35

12/0,2

60/1

75/0,625

45/0,375

120/1

Частота носителей «редкого» аллеля G у больных СД1, серонегативных по АтЩЖ (лица с генотипами АG и GG), была достоверно выше – 57/70 (81 %), чем в группе СД1 + АИТ – 33/60 (55 %), OR = 3,59, 95 % CI: 1,63–7,89, p = 0,0022. При этом частота генотипа GG недостоверно выше в группе пациентов (34 %) по сравнению с группой контроля (20 %), p = 0,11, OR = 1,7, 95 % CI: 0,94–3,13. Оценочный тест для анализа изменения степени ассоциации между генотипом CTLA-4 rs 231775 и определенной клинической формой СД1, в зависимости от числа полиморфных аллелей (тренд-тест Кохрана – Армитажа) показал статистически значимые различия между сравниваемыми генотипами (p = 0,002), что свидетельствует о наличии тенденции к высокой степени ассоциации генотипа данного полиморфизма с клинической формой сахарного диабета.

Исследование частоты встречаемости однонуклеотидной замены CT60 A/G (rs 3087243), расположенной в промоторной области гена CTLA4

Результаты исследования частот аллельных вариантов и генотипов полиморфизма CT60 A/G (rs 3087243) гена CTLA4 в выборке пациентов с СД1, сочетанным с аутоиммунным тиреоидитом, и случайной (контрольной) выборке представлены в табл. 4. Наблюдаемое распределение частот генотипов по исследованному локусу гена CTLA-4 в контроле соответствует теоретически ожидаемому равновесному распределению Харди – Вайнберга (p = 0,67).

Анализ распределения аллелей и генотипов полиморфизма rs 3087243 гена CTLA-4 среди больных СД1 с АИТ доноров не выявил статистически значимых различий (p = 1 для «редких» аллелей, p = 1 для носителей «редкого» аллеля и p = 1 для генотипов, гомозиготных по «редкому» аллелю).

Таблица 4

Распределение аллелей и генотипов полиморфизма rs 3087243 гена CTLA-4 у пациентов с СД1, сочетанным с АИТ, и в контрольной группе

Группы

Частота генотипов, абс./отн.

Частота аллелей, абс./отн.

AA

AG

GG

Всего

A

G

Всего

СД1 + АИТ

5/0,18

12/0,43

11/0,39

28/1

22/0,39

34/0,61

56/1

Контроль

18/0,17

48/0,44

42/0,39

108/1

84/0,39

132/0,61

216/1

Результаты исследования частот аллельных вариантов и генотипов полиморфизма CT60 A/G (rs 3087243) гена CTLA4 в выборке пациентов с СД1, серонегативным по АтЩЖ, и случайной (контрольной) выборке представлены в табл. 5.

Аллель G полиморфизма rs 3087243 гена CTLA-4 – более частое явление для пациентов с СД1, серонегативных по АтЩЖ (73 %), по сравнению с группой контроля (61 %), OR = 1,73, 95 % CI: 1,07–2,78. Однако анализ распределения аллелей и генотипов полиморфизма rs 3087243 гена CTLA-4 среди больных СД1 без АтЩЖ доноров выявил следующие различия, близкие к достоверным: p = 0,0314 для «редкого» аллеля, p = 0,0507 для гомозигот по «редкому» аллелю (OR = 1,42, 95 % CI: 1,00–1,97). Согласно данным других исследователей, маркер rs 3087243 гена CTLA-4 высоко достоверно ассоциирован с СД1 [22]. В связи с этим полученные нами данные, по-видимому, обусловлены малой выборкой исследуемых групп.

Таблица 5

Распределение аллелей и генотипов полиморфизма rs 3087243 гена CTLA-4 у пациентов с СД1, серонегативным по АтЩЖ, и в контрольной группе

Группы

Частота генотипов, абс./отн.

Частота аллелей, абс./отн.

AA

AG

GG

Всего

A

G

Всего

СД1 без АтЩЖ

6/0,09

23/0,35

36/0,56

65/1

35/0,27

95/0,73

130/1

Контроль

18/0,17

48/0,44

42/0,39

108/1

84/0,39

132/0,61

216/1

Результаты исследования частот аллельных вариантов и генотипов полиморфизма CT60 A/G (rs 3087243) гена CTLA4 в выборке пациентов с СД1, серонегативным по АтЩЖ, и пациентов с СД1, сочетанным с АИТ, представлены в табл. 6. Анализ распределения аллелей и генотипов полиморфизма rs 3087243 гена CTLA-4 не выявил статистически значимых различий.

Таблица 6

Распределение аллелей и генотипов полиморфизма rs 3087243 гена CTLA-4 у пациентов с СД1, серонегативным по АтЩЖ, и у пациентов с СД1, сочетанным с АИТ

Группы

Частота генотипов, абс./отн.

Частота аллелей, абс./отн.

AA

AG

GG

Всего

A

G

Всего

СД1 без АтЩЖ

6/0,09

23/0,35

36/0,56

65/1

35/0,27

95/0,73

130/1

СД1 + АИТ

5/0,18

12/0,43

11/0,39

28/1

22/0,39

34/0,61

56/1

В настоящее время не решен вопрос о взаимном влиянии отдельных локусов гена CTLA-4 и вкладе их белковых продуктов в формирование аутоиммунного воспаления. Поэтому исследования в этом направлении необходимо продолжить.

Выводы

Таким образом, полученные нами данные подтверждают результаты других исследователей о том, что СД1 ассоциирован с G(GG) в rs231775 гена CTLA-4.

При этом мы не получили доказанную ассоциацию данного полиморфизма с СД1 в сочетании с АИТ.

Пациенты с сочетанием СД1 с АИТ по распределению rs231775 ближе к норме по сравнению с изолированным СД1.

Для полиморфизма rs 3087243 гена CTLA-4 нами не выявлено достоверной ассоциации ни с одной из исследованных групп, что скорее всего связано с их малочисленностью.

Авторы декларируют отсутствие конфликта интересов, связанных с рукописью.

Источник финансирования – работа выполнена на средства, выделенные для Федеральной целевой программы «Сахарный диабет».

Рецензенты:

Алексеев Л.П., д.м.н., профессор, зам. директора, заведующий отделом иммуногенетики, ФГБУ «ГНЦ институт иммунологии» ФМБА, г. Москва;

Кондраченко М.Ю., д.м.н., профессор, ГБОУ ДПО «Пензенский институт усовершенствования врачей» МЗ РФ, г. Пенза.

Работа поступила в редакцию 28.11.2014.


Bibliographic Reference

Repina E.A., Boldyreva M.N., Suntsov Yu.I., Bateneva E.I., Kadochnikova V.V., Ilin A.V., Troshina E.A. COMPARATIVE ANALYSIS OF THE FREQUENCY DISTRIBUTION OF ALLELES AND GENOTYPES POLYMORPHISMS RS 231775 AND RS 3087243 GENE CTLA-4 IN PATIENTS WITH DIABETES MELLITUS TYPE 1 AND TYPE 1 DIABETES COMBINED WITH AUTOIMMUNE THYROIDITIS // Fundamental Research. 2014. No. 10. pp. 1171-1176;
URL: https://fundamental-research.ru/en/article/view?id=36010 (accessed: 26/09/2026).