Иммуноглобулинподобные рецепторы киллерных клеток (KIR) взаимодействуя со своими лигандами - антигенами главного комплекса гистосовместимости (HLA) I класса, играют ключевую роль в регуляции функциональной активности натуральных киллерных клеток (NK), которые, являясь важнейшим компонентом врожденного иммуннитета, обеспечивают быструю элиминацию трансформированных и инфицированных клеток, сохраняя при этом толерантность к неповрежденным клеткам организма [10]. Связывание HLA-лигандов с ингибирующими KIR-рецепторами (iKIR) приводит к подавлению функциональной активности NK-клеток, а с активирующими (аKIR) - к ее усилению.
Так же, как и система HLA, система KIR-генов обладает чрезвычайно высоким уровнем полиморфизма [4]. Полиморфизм KIR-генов и сочетания KIR-HLA являются важным иммуногенетическим фактором, играющим существенную роль в предрасположенности и/или резистентности к инфекционным, аутоиммунным и онкологическим заболеваниям. Поскольку KIR-локус расположен на хромосоме 19, а HLA-локус - на хромосоме 6, наследование генов, кодирующих рецепторы и их лиганды, происходит независимо друг от друга, что приводит к большому разнообразию комбинаций KIR/HLA у отдельных лиц. В то же время ряд исследований подтверждает наличие корреляции между частотой встречаемости KIR-генов и соответствующих HLA-лигандов, что свидетельствует о возможной коэволюции этих не связанных между собой локусов [7, 2]. Существуют достаточно выраженные межпопуляционные различия в частоте встречаемости как KIR-генов и их HLA-лигандов, так и функционально значимых комбинаций KIR/HLA, сформировавшиеся, по всей видимости, под действием разнообразных факторов отбора в определенных климатогеографических условиях.
Целью настоящего исследования явилось изучение распределения KIR-генов, HLA-лигандов и KIR/HLA комбинаций в русской популяции Северо-Западного региона Российской Федерации.
Материалы и методы исследования
Для изучения распределения KIR-генов и HLA-лигандов в русской популяции было проведено обследование 100 потенциальных доноров Республиканского Регистра доноров костного мозга/гемопоэтических стволовых клеток (Санкт-Петербург) в возрасте от 20 до 60 лет.
Геномную ДНК для проведения молекулярного типирования выделяли из лейкоцитов периферической крови с помощью коммерческого набора реагентов фирмы «Protrans» (Германия). Концентрация выделенной ДНК составляла 50-100 нг/мкл.
Генотипирование осуществляли методом полимеразной цепной реакции с сиквенс-специфическими праймерами (PCR-SSP). Для определения количества и состава KIR-генов использовали наборы «KIR Genotyping SSP Kit» (Invitrogen). Группы HLA-лигандов: HLA-C1, -C2 и -Вw4 + определяли при помощи наборов «KIR HLA ligand kit» (Olerup-SSP). Для определения HLA-A3/A11 и специфичностей HLA-B и -C дополнительно проводили молекулярное типирование с использованием наборов «PROTRANS HLA-A*/B*/Cw*» (Protrans).
Визуализацию продуктов, полученных в результате полимеразной цепной реакции, проводили посредством электрофореза в горизонтальном 2 %-м агарозном геле. Интерпретацию полученных результатов осуществляли с помощью таблиц, прилагаемых к набору праймеров.
Частоту встречаемости KIR-генов, HLA-лигандов и комбинаций KIR/HLA (2DL1 + C2, 2DS1 + C2, 2DL2/3 + C1, 2DS2 + C1, 3DL1 + Bw4, 3DS1 + Bw4, 3DL2 + A*03/*11) определяли метом прямого подсчета. Статистическую значимость различий в частоте встречаемости оценивали с использованием критерия χ2 с поправкой по Бонферрони.
Результаты исследования и их обсуждение
Все обследованные нами доноры имели по меньшей мере одну пару iKIR/HLA, что свидетельствует об исключительной значимости рестриктированного по антигенам HLA I класса ингибиторного сигнала для регуляции функциональной активности NK-клеток. В то же время 36 % лиц в русской популяции не имели пар aKIR/HLA, а у 23 % вообще отсутствовали экспрессируемые активирующие KIR-рецепторы.
Двухдоменные молекулы KIR связываются с антигенами HLA I класса локуса С. Лигандами для KIR2DL1-рецепторов являются аллотипы HLA-C, несущие в позиции 80 остаток лизина (HLA-C2). KIR2DL2 и KIR2DL3, которые сегрегируют как аллельные варианты одного гена, кодируют молекулы, взаимодействующие с аллотипами HLA-C, имеющими остаток аспарагина в позиции 80 (HLA-C1) [5]. Активирующие двухдоменные KIR-рецепторы имеют последовательность внеклеточных доменов, сходную с их ингибирующими аналогами, и могут связываться с теми же самыми лигандами, что было подтверждено многочисленными исследованиями. KIR2DS1 связывается с HLA-C2, а KIR2DS2 - с HLA-C1 антигенами [9]. Частота встречаемости функционально значимых пар 2DKIR/HLA в русской популяции Северо-Западного региона Российской Федерации представлена в табл. 1.
В соответствии с результатами генотипирования групп HLA-лигандов для двухдоменных KIR-рецепторов все обследованные доноры были разделены на три группы: С1/С2 гетерозиготы - 59 %, С1 гомозиготы - 34 % и С2 гомозиготы - 7 %. Обращает на себя внимание более высокая частота гетерозиготных лиц, по сравнению с другими европейскими популяциями, и более низкая - гомозиготных, особенно по аллелям HLA группы С2 [6].
Таблица 1
Частота встречаемости активирующих и ингибирующих двухдоменных KIR-рецепторов, их HLA-лигандов и KIR/HLA комбинаций
KIR-гены |
2DL1 |
2DS1 |
2DL2/3 |
2DL2 |
2DL3 |
2DS2 |
F( %) |
96,0 |
40,0 |
100,0 |
47,0 |
85,0 |
47,0 |
HLA-лиганды |
HLA-C2 |
HLA-C1 |
||||
F( %) |
66,0 |
93,0 |
||||
KIR + HLA |
2DL1 + HLA-C2 |
2DS1 + HLA-C2 |
2DL2/3 + HLA-C1 |
2DL2 + HLA-C1 |
2DL3 + HLA-C1 |
2DS2 + HLA-C1 |
F( %) |
63,0 |
30,0 |
93,0 |
44,0 |
78,0 |
43,0 |
В русской популяции наиболее часто встречающейся комбинацией iKIR/HLA было сочетание KIR2DL2/3 + HLA-C1 (93 %), что несколько выше частоты данной пары в других кавказоидных популяциях (около 80 %). KIR2DL2 и KIR2DL3 представляют собой группы аллельных вариантов гена KIR2DL2/3, из которых для KIR2DL2-рецепторов характерна более высокая сила связывания со своими лигандами. Частота встречаемости пары KIR2DL2 + HLA-C1 в русской популяции составила 44 %, а пары KIR2DL3 + HLA-C1 - 78 %. Причем у 15 % лиц присутствовала только комбинация KIR2DL2 + HLA-C1, у 49 % - KIR2DL3 + HLA-C1, а 29 % имели обе пары лиганд-рецептор.
Из 96 практически здоровых лиц обследованной группы, имеющих в своем генотипе ингибирующий ген KIR2DL1, 33 человека не имели лиганда для этого рецептора. В то же время из 66 лиц, имеющих аллели HLA I класса локуса С, входящих в группу HLA-C2, у 3 человек не было соответствующего рецептора. Таким образом, частота встречаемости функционально активного рецептора KIR2DL1 в русской популяции составила 63 %, что соответствует другим кавказоидным популяциям (около 60 %) [1, 6].
Частота встречаемости функционально значимых пар активирующих двухдоменных KIR-рецепторов со своими HLA-лигандами была существенно ниже, чем для ингибирующих и составила 30 % для KIR2DS1 + HLA-C2 и 43 % для KIR2DS2 + HLA-C1.
Трехдоменный ингибирующий рецептор KIR3DL1 взаимодействует с аллелями HLA-B, которые содержат эпитоп Bw4. Эти аллели подразделяются на две группы: HLA-Bw4Т80, несущие в позиции 80 остаток треонина, и HLA-Bw4I80, имеющие в данной позиции остаток изолейцина. Причем антигены HLA-Bw4I80 имеют более высокую силу связывания с рецептором, чем HLA-Bw4Т80 [5]. Активирующий рецептор KIR3DS1 имеет выраженное сходство с KIR3DL1 в строении экстрацеллюлярных доменов и, по всей видимости, взаимодействует с HLA-Bw4I80 [3]. Лигандами для структурного ингибирующего рецептора KIR3DL2 являются антигены HLA-A3 и HLA-A11.
Частота встречаемости функционально значимых пар 3DKIR/HLA в обследованной нами русской популяции Северо-Западного региона Российской Федерации представлена в табл. 2.
Таблица 2
Частота встречаемости активирующих и ингибирующих трехдоменных KIR-рецепторов, их HLA-лигандов и KIR/HLA комбинаций в русской популяции
KIR-гены |
3DL1 |
3DS1 |
3DL2 |
||||||
F( %) |
96 |
35 |
100,0 |
||||||
HLA-лиганды |
HLA-Bw4 |
HLA-Bw4 Т80 |
HLA-Bw4 I80 |
HLA-Bw4 |
HLA-Bw4 T80 |
HLA-Bw4 I80 |
HLA-A*03/11 |
HLA-A*03 |
HLA-A*11 |
F( %) |
61,0 |
35,0 |
31,0 |
61,0 |
35,0 |
31,0 |
35,0 |
24,0 |
12,0 |
KIR + HLA |
3DL1 + HLA-Bw4 |
3DL1 + HLA-Bw4 Т80 |
3DL1 + HLA-Bw4 I80 |
3DS1 + HLA-Bw4 |
3DS1 + HLA-Bw4 Т80 |
3DS1 + HLA-Bw4 I80 |
3DL2 + HLA-A*03/11 |
3DL2 + HLA-A*03 |
3DL2 + HLA-A*11 |
F( %) |
60,0 |
35,0 |
30,0 |
22,0 |
17,0 |
8,0 |
35,0 |
24,0 |
12,0 |
Трехдоменный ингибирующий рецептор KIR3DL1 был обнаружен у 96 % обследованных, но при этом его лиганды присутствовали только у 61 % лиц в популяции, и общая частота встречаемости функционально активного рецептора составила всего 60 %. Среди них KIR/HLA комбинации, содержащие аллели двух подгрупп данной группы лигандов: HLA-Bw4I80 и HLA-Bw4Т80, которые отличаются по силе взаимодействия с рецептором, распределялись приблизительно поровну - 30 и 35 % соответственно. При этом две функционально активные пары: KIR3DL1 + HLA-Bw4I80 и KIR3DL1 + HLA-Bw4Т80 имелись только у 5 % лиц в популяции. У 36 % лиц с наличием данного рецептора не было соответствующего лиганда и у одного индивидуума отсутствовал рецептор при наличии лиганда.
Частота встречаемости активирующего трехдоменного рецептора KIR3DS1 в русской популяции составила 35 %, его предполагаемого лиганда HLA-Bw4I80 - 31 %. Из числа обследованных лиц 42 % не имели ни данного рецептора, ни его лиганда, а 8 % лиц имели и лиганд, и рецептор. Таким образом, только 8 % лиц в русской популяции имели функционально активный KIR3DS1-рецептор.
Несмотря на то, что ингибирующий ген KIR3DL2 является структурным и присутствует во всех гаплотипах, HLA-лиганды для этого рецептора были определены у 35 % обследуемых. Из них 18 % имели один HLA-A*03, 10 % - один HLA-A*11 и 7 % имели два лиганда. Следовательно, только у трети популяции KIR3DL2 рецептор является функционально активным.
Нами был проведен сравнительный анализ распределения частоты встречаемости KIR-генов, HLA-лигандов и KIR/HLA комбинаций в русской популяции Северо-Западного региона Российской Федерации с аналогичными показателями других кавказоидных популяций (табл. 3, 4). В качестве групп сравнения были использованы данные совместных многоцентровых исследований [1, 2, 7].
Таблица 3
Распределение KIR-генов в различных популяциях кавказоидов [1, 2, 7]
Популяции |
KIR-гены |
||||||
2DL1 |
2DS1 |
2DL2 |
2DL3 |
2DS2 |
3DL1 |
3DS1 |
|
Россия (n = 100) |
96,0 |
40,0 |
47,0 |
85,0 |
47,0 |
96,0 |
35,0 |
Чехия (n = 125) |
95,0 |
44,6 |
58,7 |
85,1 |
57,0 |
93,4 |
38,8 |
Португалия (n = 38) |
100,0 |
31,6 |
57,9 |
94,7 |
57,9 |
89,5 |
31,6 |
Италия (n = 50) |
100,0 |
42,0 |
50,0 |
94,0 |
50,0 |
94,0 |
46,0 |
Норвегия (n = 363) |
97,5 |
40,5 |
41,6 |
92,8 |
42,4 |
95,9 |
41,6 |
США (кавказоиды) (n = 255) |
95,3 |
41,2 |
53,3 |
87,1 |
53,7 |
94,9 |
38,8 |
Испания (n = 100) |
94,0 |
39,0 |
57,0 |
85,0 |
58,0 |
91,0 |
39,0 |
Северная Ирландия (n = 223) |
97,3 |
39,5 |
51,1 |
90,1 |
52,0 |
97,8 |
39,5 |
Англия (n = 99) |
99,0 |
40,4 |
47,5 |
88,9 |
53,5 |
96,0 |
36,4 |
Дания (n = 50) |
98,0 |
36,7 |
52,0 |
96,0 |
52,0 |
98,0 |
38,0 |
Финляндия (n = 35) |
100,0 |
54,5 |
39,4 |
97,0 |
39,4 |
90,9 |
53,1* |
Примечание: * - различия в сравнении с русской популяцией статистически значимы (p < 0,05).
Таблица 4
Распределение HLA-лигандов в различных популяциях кавказоидов [1, 2, 7]
Популяции |
HLA-лиганды |
||
HLA-C1 |
HLA-C2 |
HLA-Bw4 |
|
Россия (n = 100) |
93,0 |
66,0 |
61,0 |
Чехия (n = 125) |
63,2** |
36,8** |
66,9 |
Португалия (n = 38) |
48,7** |
51,3 |
68,4 |
Италия (n = 50) |
50,0** |
50,0 |
72,0 |
Норвегия (n = 363) |
65,8** |
34,2** |
54,4 |
США (кавказоиды) (n = 255) |
59,8** |
40,2** |
57,6 |
Испания (n = 100) |
60,0** |
40,0* |
58,0 |
Северная Ирландия (n = 223) |
68,9** |
31,1** |
50,8 |
Англия (n = 99) |
58,6** |
41,4* |
66,7 |
Дания (n = 50) |
82,0 |
62,0 |
50,0 |
Финляндия (n = 35) |
77,1 |
62,9 |
51,4 |
Примечания:
* - различия в сравнении с русской популяцией статистически значимы (pс < 0,001);
** - различия в сравнении с русской популяцией статистически значимы (pс < 0,0001).
Как видно из представленной таблицы, распределение ингибирующих KIR-генов в русской популяции соответствует таковому в других популяциях кавказоидов (см. табл. 3). То же было показано нами при сравнении с другими популяциями [8].
Анализ частот встречаемости групп HLA-лигандов для двухдоменных KIR-рецепторов выявил значительные отличия русской от других кавказоидных популяций. В обследованной нами группе была обнаружена более высокая частота встречаемости аллелей группы HLA-С1, по сравнению с другими представленными популяциями, за исключением Дании и Финляндии (рис. 1). Имеющиеся в нашем распоряжении данные о распределении сочетаний KIR2DL2/3 + HLA-C1 показали различия с популяциями Чехии (χ2 = 4,90; p < 0,05) и кавказоидов США (χ2 = 8,49; p < 0,01).
Кроме того, была выявлена более высокая, по сравнению с большинством кавказоидных популяций, частота встречаемости аллелей, входящих в группу HLA-C2, которые несут в позиции 80 остаток лизина и служат лигандами для KIR2DL1 и KIR2DS1 (рис. 2). HLA-лиганды этой группы также имеют высокую частоту встречаемости в популяциях Дании и Финляндии. У жителей Италии и Португалии они встречаются несколько реже, чем в русской популяции, но это различие не достигает статистической значимости.
Рис. 1. Сопоставление частот встречаемости генов KIR2DL2/3, KIR2DS2 и HLA-C1 в русской и других кавказоидных популяциях [1, 2, 7]
Рис. 2. Сопоставление частот встречаемости генов KIR2DL1, KIR2DS1 и HLA-C2 в русской и других кавказоидных популяциях [1, 2, 7]
Не было выявлено статистически значимых отличий в распределении HLA-Bw4 по сравнению с большинством других кавказоидных популяций (рис. 3).
Рис. 3. Сопоставление частот встречаемости генов KIR3DL1, KIR3DS1 и HLA-Bw4 в русской и других кавказоидных популяциях [1, 2, 7]
Заключение
Полученные нами данные позволили выявить следующие особенности распределения иммуноглобулинподобных рецепторов киллерных клеток и их HLA-лигандов в русской популяции:
1. Частоты встречаемости KIR-генов и пар KIR-рецептор/HLA-лиганд могут существенно различаться друг от друга. Так, частота гена KIR2DL1 составляет 96 %, а пары KIR2DL1 + HLA-C2 - 63 % (χ2 = 33,41; pс < 0,0001); гена KIR3DL1 - 96 %, а комбинации KIR3DL1 + HLA-Bw4 - 60 % (χ2 = 37,76; pс < 0,0001); гена KIR3DL2 - 100 %, а сочетания KIR3DL2 + HLA-А3/11 - 35 % (χ2 = 96,30; pс < 0,0001). Таким образом, встречаемость функционально активного KIR-рецептора может быть значительно ниже, чем кодирующего его гена, что необходимо учитывать при оценке вклада KIR-системы в развитие иммунного ответа, определении предрасположенности или резистентности к ряду заболеваний.
2. Сопоставление полученных нами результатов с литературными данными показало, что распределение ингибирующих двухдоменных KIR-рецепторов в русской популяции, в целом, сходно с таковым в других популяциях кавказоидов. Однако обращает на себя внимание обнаруженная нами значительно более высокая, по сравнению с большинством европейских популяций, частота лиц, гетерозиготных по группам лигандов для этих рецепторов, и, особенно, более высокая частота аллотипов группы HLA-C1, что приводит к повышению частоты встречаемости функционально активных пар KIR2DL2/3 + HLA-C1. Эти данные необходимо учитывать при оценке генетически детерминированных особенностей цитолитической активности естественных киллеров в русской популяции и изучении ассоциативных связей KIR-генов с различными заболеваниями.
Рецензенты:
Капустин С.И., д.б.н., руководитель лаборатории биохимии ФГУ «Российский НИИ гематологии и трансфузиологии» ФМБА, г. Санкт-Петербург;
Калинина Н.М., д.м.н., профессор, главный научный сотрудник, начальник НИО клинической иммунологии Всероссийского центра экстренной радиационной медицины им. А.М. Никифорова МЧС России, г. Санкт-Петербург.
Работа поступила в редакцию 23.11.2011.
Библиографическая ссылка
Соколова Ю.В., Бубнова Л.Н., Павлова И.Е., Бессмельцев С.С. ОСОБЕННОСТИ РАСПРЕДЕЛЕНИЯ ИММУНОГЛОБУЛИНПОДОБНЫХ РЕЦЕПТОРОВ КИЛЛЕРНЫХ КЛЕТОК И ИХ HLA-ЛИГАНДОВ В РУССКОЙ ПОПУЛЯЦИИ // Фундаментальные исследования. – 2012. – № 1. – С. 115-120;URL: https://fundamental-research.ru/ru/article/view?id=29309 (дата обращения: 16.08.2024).