У особей разных возрастных состояний побеговое тело представляет собой базисимподиальную систему вегетативных и монокарпических побегов. Побеговая система A. dracunculus - взаимосвязанная система материнского и парциальных кустов. Связь межу ними осуществляется с помощью длинного подземного корневища. Корневище, выносящее на поверхность надземные побеги разных типов строится на базе анизотропных вегетативных побегов (на первых этапах онтогенеза) или анизотропных монокарпических побегов (на последующих этапах развития). Изучение побеговых систем полыни эстрагон нами проводилось с точки зрения разнообразия её побегов.
В результате проведённых нами исследований на территории Воронежской области были выделены следующие типы побегов в структуре побегового тела особей эстрагона семенного и вегетативного происхождения: 1) отротропные вегетативные и монокарпические побеги; 2) анизотропные вегетативные и монокарпические побеги: а) с короткой подземной плагиотропной частью; б) с длинной подземной плагиотропной частью.
У молодых вегетативных особей семенного происхождения структурной единицей побегового тела является удлинённый многоузловой ортотропный или слегка анизотропный вегетативный побег. Общая длина побега составляет 70-140 см с числом узлов от 18 до 58. Надземная часть побега ортотропная, с хорошо выраженными междоузлиями. Подземная часть побега (в пределах 1 см) несёт в узлах чешуевидные листья, в пазухах которых находятся почки возобновления. Эта зона с возрастом становится главой симподиального каудекса.
Анизотропные вегетативные побеги развиваются на последующих этапах онтогенеза растения. Анизотропные вегетативные побеги с короткой плагиотропной частью (1,5-5 см) формируются в прегенеративном и начале генеративного периодов. Их длина составляет 60-120 см, количество узлов - 35-58. Если длина плагиотропной части превышает 5,5 см, то такой побег мы относим анизотропным вегетативным побегам с длинной подземной плагиотропной частью. Плагиотропная часть может достигать от 6 до 20 и более см. Ортотропная часть составляет 110-155 см. Побеги такого типа 125-165 см высотой с числом узлов от 35 до 55 развиваются у особей семенного происхождения в генеративном периоде. В месте перехода плагиотропной части в ортотропную расположен ансамбль почек возобновления (3-5).
Структурной единицей дочерних кустов A. dracunculus, перешедших к цветению, является монокарпический побег. Побег - многоузловой (35-65), ортотропный или анизотропный, общей высотой от 60 см до 2 м. Анизотропные монокарпические побеги с короткой плагиотропной частью (1,5-3 см) формируются у молодых генеративных особей. Анизотропные монокарпические побеги с длинной плагиотропной частью (5-30 см) свойственны средневозрастным и старым генеративным растениям. В месте перехода плагиотропной части в ортотропную у обоих типов анизотропных побегов располагаются почки возобновления (4-6). Анизотропные побеги всех типов являются основой для формирования дочерних кустов.
Выявленное разнообразие побегов и побеговых систем определяет специфику структуры жизненной формы полыни эстрагон на разных этапах онтоморфогенеза.