Темпоральные (временные) аспекты играют существенную роль в медицинском знании. Болезни характеризуются сложными паттернами симптомов, которые появляются и исчезают в определенной временной последовательности. Во многих случаях этот темпоральный паттерн симптомов является существенным для диагноза болезни. Рассмотрим, например, задачу диагноза гепатита В на основе выявления антигенов и антител. Для диагноза гепатитов выполняются серологические исследования, при которых могут быть обнаружены антитела к вирусам гепатита. Первая фаза после заражения вирусом гепатита В - инкубационный период, который обычно длится от двух до четырех месяцев, хотя встречается очень короткий период (10 дней) или очень длинный (9 месяцев). К концу инкубационного периода обнаруживается определенные антитела, которые указывают на начало острой фазы заболевания. Затем наступает период выздоровления, при котором происходит сероконверсия антигенов вируса гепатита в антитела. Последний период - фаза выработки иммунитета, характеризуемого положительным тестом на антитела. Возможны различные течения гепатита. Эти течения описываются как курсы, которые представляются в виде системы событий, определяемых появлением и исчезновением определенных антигенов и антител. Имеется 4 основных курса, анализ которых показывает, что:
- количественная темпоральная информация (длины временных интервалов событий) представляется средними значениями, тогда как индивидуальные значения могут варьировать от случая к случаю. Но качественная темпоральная информация (например, что данное антитело появляется в курсе раньше другого) является устойчивой;
- все курсы выглядят одинаково с точки зрения серологических данных. Они различаются порядком их появления.
Это подсказывает, что в формальную модель (онтологию) для представления медицинского знания о течении болезней, следует включать темпоральные отношения. Известной логикой темпоральных отношений является интервальная логика Аллена [Allen, 1983].
Мы рассмотрим расширение системы концептуальных языков «Бинарная Модель Знаний» (БМЗ), которое включает средства логики Аллена, и покажем как, используя БМЗ составить онтологию, представляющую знание о течении гепатита В.
A propos. Медицинские онтологии используются при построении семантических вебсервисов для биоинформатики, а также при составлении метаданных для биомедицинских ресурсов в Семантическом вебе.